首都·东京，为迎接峰会举办而急速进行着的「宇宙天梯计划」。 为专门应对使用了"强化装甲<Will Wear>"的犯罪行为而创设的，警察厅警备局第五特别公安课第三机动强袭室第八课——通称<第八>。<第八>因从LOGOS的恐怖行动的獠牙中拯救了日本，现今是沐浴于全日本的注目之下的存在。然而，恶用<Will Wear>的犯罪数量，在那之后依旧日日攀升……。 迎接了新成员的黑骑与第八的各位，今天也是用智慧与勇气与伶牙俐齿以及在民间警察的协力之下，奋斗于凶恶事件的第一线！ 决裁完毕，出动！！

由于第三次流砂现象，东京的一部分沉入泥泞之中。利用复兴作业中建造的高出力强化外骨骼“Willware”进行的犯罪日益增加，为了应对此事，警察厅警备局在吉祥寺分室新设了第五特别公安课第三机动强袭室第八系——通称“第八”。

在剧中的世界里，因为发生「第三次流砂现象」导致东京的一部分沉入泥泞下。为了快速重建复 甦，企业发明一种高出力强化外骨骼「Willware」方便施工；…

因为在风祭流传着未确认生物的情报，以及超自然的现象之类的似真非真的传闻。瑚太朗向超自然研究会的部长，千里朱音的求助，于是展开了涉及到瑚太朗认识的学生们的调查。对于瑚太朗来说，原本只是抱着一点冒险心态而已。只要能和热闹的伙伴们一起度过的话，这样就足够了。但瑚太朗还没有注意到，他将要探求那无人知晓的“真实”。

由漫画家五十岚三喜夫创作的人气作品《暖暖日记》是一部光看画风就让人觉得治愈有趣的漫画，主人公是名为暖暖的海獭，故事则在各种无厘头的搞笑间讲述一些哲学道理，这样的设定而引发了很多关注并赢得了好评。

故事内容延续第一部TV版《攻壳机动队 STAND ALONE COMPLEX》的剧情继续发展。但TV版的2部作品与剧场版无甚联系，可以看做是两个平行世界里发生的事情。 这次TV版第2季的制作班底与第一部相同，同时剧情表达上和第一季一样，每话由不同故事构成，各自独立成章，却贯穿着同一条主线。在剧情上同时电影版导演押井守也参与了协力，不过电影版中凄凉的气氛没有在TV版第二季中体现。

经历过圣石之种事件半年后的高町奈叶与菲特·泰斯特罗莎两人则以朋友方式重逢，但随后卷入了一场袭击奈叶的大战。敌人目的正是以非法手段夺取魔导师的魔力资质，从而引发了时空管理局的重视和调查。

智炫是首尔一所大学的新生。他来自一个小镇，习惯于住在安静的乡村。搬到繁忙的韩国首都让他感到迷失方向和困惑。与此同时，年长的宰元在完成义务兵役后，返回首尔——以及同一所大学。两人开始对彼此产生好奇心。当他们加入了同一个冲浪俱乐部时，他们的关系开始升温。

云起　　约翰尼·沃里克（比尔·奈伊 ）是一个在MI5工作多年的官员，他的上司、同时也是他最好的朋友班尼迪克特·贝伦突然间蹊跷地死掉了，只留下了一个令人费解的文件。在阅读了这些文件之后，沃里克发现这起中揭示的内容令人震惊，它甚至能动摇自己工作的整个组织。与此同时，沃里克与自己的新邻居相遇，这个漂亮的女人叫做南希·皮尔潘（蕾切尔·薇姿）。她对沃里克的兴趣与几乎无微不至的照顾早已超越了一般意义上的朋友关系。因为班尼迪克特的死，沃里克被迫离开了自己的工作岗位，而他也只有依靠着一己之力去解开事件的真相。